陽離子聚丙烯酰胺是一種陽離子有機高分子絮凝劑，絮凝機理主要是吸附電中和機理和吸附架橋機理，其化學結構為：
膠體表面一般帶負電荷，加入的陽離子聚丙烯酰胺絮凝劑被吸附在膠體顆粒上，使膠體顆粒表面電荷中和，降低了ζ電位，使膠體脫穩和絮凝易于發生。
陽離子聚丙烯酰胺對膠體的吸附架橋不同階段示意圖如下：
（1）絮凝較佳投藥量
（2）絮凝劑投入過多
（3）絮體破碎
影響絮凝效果的因素：
（1）絮凝劑的平均分子量：分子量太小，架橋能力差；分子量太高，溶解性能差，鏈運動受阻并可能重疊，對吸附和架橋作用不利；
（2）絮凝劑的相對活性：兩種不同單體共聚而成的聚合物，由于單體比例不同，形成的聚合物的相對活性就不同，絮凝效果也因此有所不同。
不同污水的水質也影響著絮凝效果，在實際應用中，應根據具體情況選擇合適的絮凝劑以及投藥量。
